Организации и предприниматели при выборе пониженных ставок 5 и 7 % должны применять их последовательно 12 последовательных налоговых периодов (три года). Их использование начинается с периода, когда была представлена первая декларация по НДС с такими ставками. До окончания этого срока перейти на ставку НДС 20 % нельзя.

Досрочное прекращение применения пониженных ставок возможно, если налогоплательщик на УСН со следующего года получит автоматическое освобождение от уплаты НДС. То есть его доходы за предыдущий год окажутся менее 60 млн рублей либо доходы за предыдущий год или в текущем году превысят 450 млн рублей.

При этом переход со ставки НДС 5 % на 7 % и обратно не прерывает течения указанного срока, а освобождение от НДС – прерывает. Его отсчет начинается заново, когда основания для освобождения будут утрачены.

Например, налогоплательщик на УСН с начала 2025 года применял ставку 5 %, а с декабря стал исчислять налог по ставке 7 %, так как превысил пороговое значение доходов (250 млн рублей), и продолжил применять ее в 2026 году. Однако из-за снижения выручки с 2027 года он снова начал применять 5 %. В такой ситуации считается, что срок применения специальных налоговых ставок (12 кварталов) не прерывался.

Другой пример: налогоплательщик на УСН с начала 2025 года применял ставку 5 %, а с 2026 года освобожден от исчисления НДС. Если в 2026 году он утратит право на освобождение, то со следующего месяца он может выбрать как общую (20 %), так и специальную (5 %) ставку НДС. При этом выбранная им ставка должна применяться ко всем операциям, которые облагаются данным налогом (то есть не освобождены от налогообложения НДС). Не допускается применение разных ставок в зависимости от того, кто приобретает соответствующие товары, работы или услуги.